Het FAVV controleert de veiligheid van de voedselketen, maar de wetgeving errond vorm geven, dat is het domein van het directoraat-generaal (DG) Dier, Plant en Voeding. Denk onder andere aan ggo’s, maar ook aan de toelating van gewasbeschermingsmiddelen op nationaal niveau. Vooral op dat laatste domein zit er nog wel eens ruis op de verbinding tussen de verschillende overheidsniveaus.