Daarna specialiseerde hij zich in licht transportmodellering tijdens een verblijf van 6 maanden aan de School for Chemical Engineering and Advanced Materials van de Universiteit van Newcastle (Groot-Brittanië), en in Chemometrie tijdens een verblijf van 6 maanden in het Norwegian Food Research Institute in Åss (Noorwegen). Sinds 2010 is hij universitair docent aan de Afdeling Biosystemen van de KU Leuven. In 2019 werd hij gepromoveerd tot hoogleraar in zijn vakgebeid.
Wouter Saeys is afkomstig van Aalst en doet in zijn vrije tijd aan paardensport. Hij is een bekend en gewaardeerd actief lid in het LRV-milieu. Paardensport is nauw verbonden met platteland en landbouw. Zijn echtgenote komt ook uit een landbouwersgezin. Zijn schoonouders baten een landbouwbedrijf uit.