Organische stof is het materiaal waaruit organismen zijn opgebouwd. Het bestaat vooral uit organische componenten: koolstofverbindingen die ook waterstof bevatten. Organische materiaal in de bodem omvat veel verschillende dingen. Je kan het opsplitsen in verse materiaal (bladeren, takjes, kleine diertjes die aan het afsterven zijn), maar ook getransformeerd organische materiaal, het organische stof, waarbij de oorsprong van het materiaal niet meer herkenbaar is. Die bestaat enerzijds uit een labiele fractie die snel mineraliseert door de micro-organismen en anderzijds uit de stabiele fractie die voor de behuizing van het bodemleven zorgt. De bodem bestaat voor het grootste deel uit organische stof, namelijk 33-50%.
In de bodem is het bodemvoedselweb aanwezig, waaronder alle bodemorganismen die betrokken zijn bij het omzetten van organische stof in de bodem. Hierbij zal het het bodemleven nutriënten vrijzetten voor de gewassen.